Генетика - кейс 87 — задача № 87
Обратилась семья для уточнения диагноза у 1,5 летней дочери.
УСЛОВИЕ СИТУАЦИОННОЙ ЗАДАЧИ
Ситуация
Обратилась семья для уточнения диагноза у 1,5 летней дочери.
Жалобы
Эпизодические рвоты, задержку развития.
Анамнез заболевания
С 3 дня жизни рецидивирующие эпизоды рвоты, спутанности сознания. Наблюдается неврологом в связи с задержкой моторного развития. Задержка предречевого и речевого развития.
В анализах крови отмечается метаболический ацидоз и гипераммонемия.
Проведено исследование МРТ головного мозга: двустороннее повышение интенсивности сигнала в области базальных ганглиев.
Анамнез жизни
Девочка от 1 беременности. Роды в срок. При рождении масса 3200г, длина 48 см, АПГАР 7/8б. Перинатальный период без особенностей.
Генеалогия: брак не кровнородственный, родители здоровы.
Объективный статус
Фенотип обычный, национальный. Микроцефалия, генерализованная гипотония, дистония рук и ног.
Результаты обследования
Спектр аминокислот и ацилкарнитинов крови методом ТМС (тандемной масспектрометрии)
ТМС крови: С3 повышен до 8,75 мкМ/л (норма 0,13-7,4 мкМ/л), С0 – 16,7 мкМ/л (норма 8-190 мкМ/л).
Спектр аминокислот мочи методом хроматографии
{nbsp}
*Заключение:* В моче пациента повышена концентрация метилмалонвой кислоты до 1946,19 мМ/моль CRE (норма 0-2 мМ/моль CRE).
Концентрация птеринов мочи
Патологии не выявлено
Результаты обследования
Проведение секвенирования методом NGS по панели генов, включающих в себя гены MUT (OMIM: * 609058) MMAA (OMIM:* 607481), MMAB (OMIM:*607568), MCEE (OMIM:* 608419), MMACHC (OMIM:*609831)
Методом NGS секвенирования по панели «587 генов, ассоциированных с наследственными болезнями обмена веществ» выявлены изменения: ранее не описанные изменения нуклеотидной последовательности с.35С>G (p.Ser12*) и с.358А>G (p.Asn120Asp) гена _MUT_ (OMIM:* 609058) в компаунд гетерозиготном состоянии.
Результаты обследования
Подтверждение наличия выявленной нуклеотидной замены у пробанда методом секвенирования по Cенгеру
В результате секвенирования по Сенгеру у ребёнка обнаружены две мутации в гене _MUT_ (OMIM:* 609058):
1)нонсенс-мутация с.35С>G (p.Ser12*) в гетерозиготном состоянии;
2)несинонимичная замена с.358А>G (p.Asn120Asp) в гетерозиготном состоянии.
Обследование биологических родителей пробанда методом секвенирования по Сенгеру на наличие выявленной мутации
У отца пробанда: в гене _MUT_ обнаружена нонсенс-мутация с.35С>G (p.Ser12*) в гетерозиготном состоянии;
У матери пробанда: в гене _MUT_ обнаружена несинонимичная замена с.358А>G (p.Asn120Asp) в гетерозиготном состоянии.
Заключение из исходной задачи
Диагноз
Метилмалоновая ацидурия (OMIM:* 251000)
Посмотреть ответ и обоснования из источника
Правильные ответы: спектра аминокислот мочи методом хроматографии; спектра аминокислот и ацилкарнитинов крови методом ТМС (тандемной масспектрометрии)
- спектра аминокислот мочи методом хроматографии
Комментарии: Дети любого возраста с повторными приступами рвоты, вялости, сонливости, гипотонии, кетоацидоза нуждаются в обследовании на метилмалоновую аминоацидурию
Клинические рекомендации. Метилмалоновая ацидурия у детей
(1)
Комментарии: Рекомендуется проведение тандемной масс-спектрометрии (МС/МС), для определения содержания в крови пропионилкарнитина (С3) и свободного карнитина (С0), глицина в крови, почечной экскреции органических кислот - метилмалоновой, 3-гидроксипропионовой, 3-гидрокси-n-валериановой, метиллимонной, пропионилглицина
(2) - спектра аминокислот и ацилкарнитинов крови методом ТМС (тандемной масспектрометрии)
Комментарии: Дети любого возраста с повторными приступами рвоты, вялости, сонливости, гипотонии, кетоацидоза нуждаются в обследовании на метилмалоновую аминоацидурию
Клинические рекомендации. Метилмалоновая ацидурия у детей
(1)
Комментарии: Рекомендуется проведение тандемной масс-спектрометрии (МС/МС), для определения содержания в крови пропионилкарнитина (С3) и свободного карнитина (С0), глицина в крови, почечной экскреции органических кислот - метилмалоновой, 3-гидроксипропионовой, 3-гидрокси-n-валериановой, метиллимонной, пропионилглицина
(2)
Посмотреть ответ и обоснования из источника
Правильный ответ: метилмалоновая ацидурия (МКБ 10: Е71.1)
- метилмалоновая ацидурия (МКБ 10: Е71.1)
Комментарии: Диагностика метилмалоновой ацидурии основана на анализе родословной, оценке данных анамнеза, клинических проявлений, результатах анализа уровня аминокислот изолейцина, валина, метионина, треонина, глицина в крови, определении содержания в крови пропионилкарнитина (С3) и свободного карнитина (С0), почечной экскреции органических кислот - 3-гидроксипропионовой, метиллимонной, пропионил- и тиглилглицина.
Клинические рекомендации. Метилмалоновая ацидурия у детей.
(1)
Посмотреть ответ и обоснования из источника
Правильный ответ: проведение секвенирования методом NGS по панели генов, включающих в себя гены _MUT_ (OMIM:* 609058), _MMAA_ (OMIM:* 607481), _MMAB_ (OMIM:* 607568), _MCEE_ (OMIM:* 608419), _MMACHC_ (OMIM:* 609831)
- проведение секвенирования методом NGS по панели генов, включающих в себя гены _MUT_ (OMIM:* 609058), _MMAA_ (OMIM:* 607481), _MMAB_ (OMIM:* 607568), _MCEE_ (OMIM:* 608419), _MMACHC_ (OMIM:* 609831)
Комментарии: Для подтверждения диагноза и медико-генетического консультирования рекомендуется проводить молекулярно-генетическое исследование с целью выявления мутаций в генах _MUT, MMAA, MMAB, MCEE, MMACHC_
Клинические рекомендации. Метилмалоновая ацидурия у детей.
(1)
Посмотреть ответ и обоснования из источника
Правильные ответы: подтвердить наличие выявленной нуклеотидной замены у пробанда методом секвенирования по Cенгеру; обследовать биологических родителей пробанда методом секвенирования по Сенгеру на наличие выявленной мутации
- подтвердить наличие выявленной нуклеотидной замены у пробанда методом секвенирования по Cенгеру
Комментарий: В настоящее время NGS зарегистрирован как научный метод исследования, поэтому для установления диагноза на молекулярно-генетическом уровне необходимо все находки подтверждать с помощью «золотого стандарта» - секвенирования по Сенгеру.
http://med-gen.ru/about/Structure/sekvenirovanie-po-sengeru.php
Комментарий: Обязательно проведение подтверждения результатов анализа NGS с помощью ортогональных методов для всех вариантов сиквенса, классифицированных как патогенные, вероятно патогенные и неопределенного значения для Менделевских заболеваний. Методы могут включать, но не ограничены: секвенирование таргетной области ДНК по Сенгеру, рестрикционный анализ, MLPA¬анализ, тестирование членов семьи пациента
О.П. Рыжкова, А.В. Поляков, М.Ю. Скоблов и др.
Рекомендации для интерпретации данных, полученных методом Next Generation Sequencing (NGS), 2016 г., стр.22
Комментарий: Все варианты нуклеотидной последовательности, указанные в заключении, должны быть подтверждены секвенированием по Сэнгеру или другой валидированной технологией.
Рыжкова О.П., Кардымон О.Л., Прохорчук Е.Б. и др.
Руководство по интерпретации данных последовательности ДНК человека, полученных методами массового параллельного секвенирования (MPS) (редакция 2018, версия 2), стр. 14– но это статья - обследовать биологических родителей пробанда методом секвенирования по Сенгеру на наличие выявленной мутации
Обследование родителей на наличие выявленной мутации необходимо для оценки роли выявленной нуклеотидной замены в этиологии заболевания ребёнка
Комментарий: Обязательно проведение подтверждения результатов анализа NGS с помощью ортогональных методов для всех вариантов сиквенса, классифицированных как патогенные, вероятно патогенные и неопределенного значения для Менделевских заболеваний. Методы могут включать, но не ограничены: секвенирование таргетной области ДНК по Сенгеру, рестрикционный анализ, MLPA-анализ, тестирование членов семьи пациента
О.П. Рыжкова, А.В. Поляков, М.Ю. Скоблов и др.
Рекомендации для интерпретации данных, полученных методом Next Generation Sequencing (NGS), 2016 г., стр.22
Комментарий: Проведение дополнительных анализов, таких как секвенирование по Сэнгеру для верификации выявленных вариантов, анализ ДНК родителей для установления цис-, транс- положения выявленных вариантов, вариантов de novo, родства и др.
Рыжкова О.П., Кардымон О.Л., Прохорчук Е.Б. и др.
Руководство по интерпретации данных последовательности ДНК человека, полученных методами массового параллельного секвенирования (MPS) (редакция 2018, версия 2), стр. 15– но это статья
Посмотреть ответ и обоснования из источника
Правильный ответ: Метилмалоновая ацидурия (OMIM:* 251000)
- Метилмалоновая ацидурия (OMIM:* 251000)
Диагноз установлен на основании клинической картины, повышения уровня биохимических маркеров, а также результатов молекулярно-генетических методов исследования.
Клинические рекомендации. Метилмалоновая ацидурия у детей.
(1)
(2)
Посмотреть ответ и обоснования из источника
Правильный ответ: 25% независимо от пола
- 25% независимо от пола
В случае аутосомно-рецессивных заболеваний, рекуррентный риск составляет 25%
Комментарии: ………… Тип наследования при всех генетических вариантах – аутосомно-рецессивный. Также описаны формы ММА, обусловленные истощением митохондриальной ДНК и связанные с мутациями геновSUCLA2, SUCLG1. Данные заболевания относятся к группе митохондриальных энцефалопатий и тактика их лечения отличается от терапии других форм метилмалоновой ацидурии [3,4].
Клинические рекомендации. Метилмалоновая ацидурия у детей.
(1)
Комментарии: Дети с подозрением на ММА требуют тщательного обследования и наблюдения. Семьи, в которых есть больные с установленным диагнозом ММА, должны пройти медико-генетическое консультирование, так как риск повторного рождения больного ребенка в семье составляет 25%.
(2)
При аутосомно-рецессивном заболевании родители являются гетерозиготными носителями мутантного гена
Комментарий: Аутосомно-рецессивный тип наследования характеризуется передачей заболевания от здоровых родителей детям с вероятностью 25%
Генетика. Учебник для вузов/Под.ред. академ.РАМН В.И. Иванова. - М.: ИКЦ«Академкнига», 2006,2007 - 639 с.:ил., стр. 453, стр. 455
Посмотреть ответ и обоснования из источника
Правильный ответ: возможно проведение пренатальной диагностики при наступлении следующей беременности
- возможно проведение пренатальной диагностики при наступлении следующей беременности
Комментарии: Пренатальная диагностика метилмалоновой ацидемии– комплексная дородовая диагностика с целью выявления метилмалоновой ацидемии на стадии внутриутробного развития путем молекулярно-генетического исследования биоптата хориона и определения мутации соответствующего гена.
Клинические рекомендации. Метилмалоновая ацидурия у детей.
(1)
Комментарии: Профилактические меры включают медико-генетическое консультирование семей, пренатальную и/или преимплантационную диагностику, которые проводятся с помощью молекулярно-генетического исследования биоптата хориона с целью выявлением мутации соответствующих генов.В ряде случаев, установление первичного молекулярно-генетического дефекта позволяет скорректировать тактику ведения беременности.
(2)
Посмотреть ответ и обоснования из источника
Правильный ответ: кобаламином
- кобаламином
Комментарии: При установлении диагноза метилмалоновой ацидурии рекомендовано провести пробное лечение витамином В12 для определения формы заболевания - В12-резистентная или В12-зависимая.
Клинические рекомендации. Метилмалоновая ацидурия у детей.
(1)
Комментарии: с этой целью назначают короткий курс (8-10 дней) витамина В12 в дозе 1 мг/сут под контролем уровня пропионилкарнитина в крови и экскреции метилмалоновой кислоты. Снижение этих показателей на 50% и более от исходных уровней свидетельствует о В12-зависимой форме болезни. Детям с установленной В12-зависимой формой метилмалоновой ацидемии назначают длительное лечение витамином В12в средней дозе 1-5 мг/сут. (в отдельных случаях до 15 мг/сут.).
(2)
Посмотреть ответ и обоснования из источника
Правильный ответ: после взятия анализов, не дожидаясь их результатов
- после взятия анализов, не дожидаясь их результатов
Комментарии: Рекомендовано диетическое лечение, которое начинают при подозрении на наследственное нарушение аминокислотного обмена сразу после взятия анализов, не дожидаясь их результатов.
Клинические рекомендации. Метилмалоновая ацидурия у детей.
(1)
Комментарии: Рекомендовано ограничить поступление белка (до получения результатов, подтверждающих метаболическое заболевание): для детей первого полугодия жизни – грудное вскармливание или вскармливание детскими молочными смесями с низким содержанием белка (1,2 -1,3 г/100 мл восстановленного продукта). Для детей старше 6 месяцев - исключение высокобелковых продуктов (мясо, творог, рыба) из рациона
(2)
Посмотреть ответ и обоснования из источника
Правильный ответ: метионин, треонин, валин, изолейцин
- метионин, треонин, валин, изолейцин
Комментарии: Рекомендована обязательная компенсация дефицита белка за счет специализированных смесей на основе аминокислот, соответствующих возрастным потребностям ребенка в основных пищевых веществах и энергии, но не содержащих метионин, треонин, валин, изолейцин. В начале лечения и в период метаболических кризов в течение 24 – 72 часов (не более!) использовать только специализированную смесь аминокислот
Клинические рекомендации. Метилмалоновая ацидурия у детей.
(1)
Посмотреть ответ и обоснования из источника
Правильный ответ: левокарнитин
- левокарнитин
Комментарии: С целью усиления связывания пропионового радикала и устранения карнитиновой недостаточности больным назначают большие дозы карнитина. Рекомендуется использовать только L-формы карнитина.
Клинические рекомендации. Метилмалоновая ацидурия у детей.
(1)
Комментарии: Дети раннего возраста получают левокарнитин из расчета 80-100 мг/кг массы тела в сутки за 2-3 приема, дети старшего возраста - 50-80 мг/кг/сут. Суточная доза не должна превышать 3 г. Терапия проводится непрерывно.
(2)
Посмотреть ответ и обоснования из источника
Правильный ответ: анализ спектра аминкислот и ацилкарнитинов крови и мочи
- анализ спектра аминкислот и ацилкарнитинов крови и мочи
Комментарии: В процессе комплексного лечения рекомендуется осуществлять контроль клинических показателей клинического анализа крови, а также аминокислот, свободного карнитина и пропионилкарнитина, проводить определение почечной экскреции метилмалоновой кислоты.
Клинические рекомендации. Метилмалоновая ацидурия у детей.
(1)
Комментарии: Кратность проведения анализов зависит от состояния ребенка, но в период инфекционных заболеваний, метаболического криза определение аминокислот и карнитинов осуществляют не реже 1 раза в 7-10 дней, КЩС - ежедневно до стабилизации показателей.Уровни метионина, треонина, валина, изолейцина в крови в результате лечения должны быть приближены к референсным возрастным значениям (таблица 3), особенно важно обеспечивать нормальный сывороточный уровень аминокислот с разветвленной углеродной цепью. Так, недостаточное потребление белка и дефицит изолейцина являются причиной развития тяжелого акродерматита и служат основанием для дополнительного введения в рацион питания L-изолейцина в дозе 50-100 мг/сут в зависимости от степени дефицита.
(2)
Формулировки, ответы и обоснования приведены по исходному банку учебных материалов для подготовки к аккредитации.
Источники: База приложения «Аккредитация медработников» (09.09.2026)