Генетика - кейс 7 — задача № 7

Правильные ответы: УЗИ органов малого таза (обследование супруги); анализ крови для определения группы крови и резус-фактора обоим супругам; спермиологическое исследование (обследование супруга)

• УЗИ органов малого таза (обследование супруги)

  УЗИ проводится с целью исключения возможных пороков органов репродуктивной системы
  
  Порядок использования вспомогательных репродуктивных технологий, противопоказания и ограничения к их применению.
  Приложение №1 к приказу Министерства здравоохранения РФ от 30 августа 2012г. №107н
  
  https://www.garant.ru/products/ipo/prime/doc/70218364/

• анализ крови для определения группы крови и резус-фактора обоим супругам

  Причиной невынашивания может быть несовместимость по группе крови АВО и резус-фактору
  
  Порядок использования вспомогательных репродуктивных технологий, противопоказания и ограничения к их применению.
  Приложение №1 к приказу Министерства здравоохранения РФ от 30 августа 2012г. №107н
  
  https://www.garant.ru/products/ipo/prime/doc/70218364/

• спермиологическое исследование (обследование супруга)

  Спермиологическое исследование проводится с целью исключения мужского фактора бесплодия
  
  Порядок использования вспомогательных репродуктивных технологий, противопоказания и ограничения к их применению.
  Приложение №1 к приказу Министерства здравоохранения РФ от 30 августа 2012г. №107н
  
  https://www.garant.ru/products/ipo/prime/doc/70218364/

Правильный ответ: аутосомно-рецессивному

• аутосомно-рецессивному

  Согласно базе данных OMIM, спинальная мышечная атрофия I-IV типа (в т.ч. болезнь Верднига-Гоффмана) наследуется аутосомно-рецессивно
  
  (OMIM:* 253300)

Правильный ответ: _SMN1_

• _SMN1_

  Комментарий: Спинальная мышечная атрофия типа I (СМА1) развивается вследствие точковой мутации или делеции 7-8 экзона гена _SMN1_ (OMIM:* 600354) в гомозиготном или компаунд-гетерозиготном состоянии.
  
  Генетика. Учебник для вузов/Под. ред. академ. РАМН В.И. Иванова. - М.: ИКЦ «Академкнига», 2006,2007 - 639 с.:ил. (Глава 21. Моногенные болезни человека. Раздел 21.5.2.3 Проксимальная спинальная амиотрофия, стр. 458 - 462)
  
  Открытая база данных OMIM: https://omim.org/entry/600354

Правильный ответ: делеция 7 и/или 8 экзона гена _SMN1_ в гомозиготном состоянии

• делеция 7 и/или 8 экзона гена _SMN1_ в гомозиготном состоянии

  Комментарий: Более 95% больных с 1-3 вариантами САМ имеют делецию 7 и/или 8 экзона теломерной копии SMN-гена в гомозиготном состоянии (гена выживаемости мотонейронов)
  
  Генетика. Учебник для вузов/Под. ред. академ. РАМН В.И. Иванова. - М.: ИКЦ «Академкнига», 2006, 2007 - 639 с.:ил. (Глава 21. Моногенные болезни человека. Раздел 21.5.2.3 Проксимальная спинальная амиотрофия, стр. 458 - 462)

Правильный ответ: 40-50

• 40-50

  Показатели частоты в различных популяциях варьируют от 1:6000 на 1:10000 новорожденных, что позволяет рассчитать, что гетерозиготным носителем мутации в гене _SMNt_ является каждый 40-50 чел. У жителей Московского региона частота носительства делеций гена _SMNt_ составляет 1:36 чел. (2,8%)
  
  Забненкова В.В., Щагина О.А., Поляков А.В. Результаты анализа носительства спинальной мышечной атрофии с использованием новой медицинской технологии «Количественный метод детекции числа копий генов локуса СМА».Медицинская генетика. 2016;15(2):18-23.
  
  https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2016-2-18-23
  
  V.V. Zabnenkova, E.L. Dadali, M.G. Spiridonova, R.A. Zinchenko, A.V. Polyakov, 2012, published in Genetika, 2012, Vol. 48, No. 8, pp. 983–992.

Правильный ответ: определение числа копий 7 и 8 экзонов в генах _SMN1_ и _SMN2_ методом MLPA

• определение числа копий 7 и 8 экзонов в генах _SMN1_ и _SMN2_ методом MLPA

  Метод MLPA для определения числа копий генов локуса СМА обеспечивает 100% точность диагностики при определении количества копий генов на геном. Однако 0,1% носителей в популяции имеют обе копии гена _SMNt_ на одной хромосоме (в цис-положении) и их генотип трактуют как генотип скрытого носителя. Таким образом, информативность данного метода не достигает 100%.
  
  Другого более точного метода для оценки числа копий генов локуса СМА в настоящий момент не существует.
  
  Забненкова В.В., Щагина О.А., Поляков А.В. Результаты анализа носительства спинальной мышечной атрофии с использованием новой медицинской технологии «Количественный метод детекции числа копий генов локуса СМА». Медицинская генетика. 2016;15(2):18-23.
  
  https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2016-2-18-23
  
  (OMIM:* 253300)
  
  https://omim.org/entry/253300

Правильный ответ: необходимо методом MLPA на наличие числа копий 7 и 8 экзонов в генах _SMN1_ и _SMN2_

• необходимо методом MLPA на наличие числа копий 7 и 8 экзонов в генах _SMN1_ и _SMN2_

  Метод MLPA для определения числа копий генов локуса СМА обеспечивает 100% точность диагностики при определении количества копий генов на геном. Однако 0,1% носителей в популяции имеют обе копии гена _SMNt_ на одной хромосоме (в цис-положении) и их генотип трактуют как генотип скрытого носителя. Таким образом, информативность данного метода не достигает 100%.
  
  Другого более точного метода для оценки числа копий генов локуса СМА в настоящий момент не существует.
  
  Забненкова В.В., Щагина О.А., Поляков А.В. Результаты анализа носительства спинальной мышечной атрофии с использованием новой медицинской технологии «Количественный метод детекции числа копий генов локуса СМА». Медицинская генетика. 2016;15(2):18-23.
  
  https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2016-2-18-23
  
  (OMIM:* 253300)
  
  https://omim.org/entry/253300

Правильный ответ: низкий

• низкий

  Комментарий:
  
  Тип наследования СМА 1 является аутосомно-рецессивным, который характеризуется 25% риском рождения больного ребёнка в случае носительства мутации в гене обоими родителями.
  
  В нашем случае у супруги носительство мутации в гене _SMNt_ (_SMN1_) не обнаружено. Известно, что 0,1% носителей в популяции имеют обе копии гена _SMNt_ на одной хромосоме (в цис-положении) и их генотип трактуют как генотип скрытого носителя.
  
  Однако даже с учётом этого риск будет составлять не более 0,025% (0,1%х1/4=0,025%), что трактуется как низкий.
  
  (OMIM:* 253300)
  
  https://omim.org/entry/253300
  
  Генетика. Учебник для вузов/Под. ред. академ. РАМН В.И. Иванова. - М.: ИКЦ «Академкнига», 2006,2007 - 639 с.:ил., стр. 453 – 455
  
  Забненкова В.В., Щагина О.А., Поляков А.В. Результаты анализа носительства спинальной мышечной атрофии с использованием новой медицинской технологии «Количественный метод детекции числа копий генов локуса СМА».Медицинская генетика. 2016;15(2):18-23.
  
  https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2016-2-18-23

Правильный ответ: преимплантационного генетического тестирования эмбрионов на анеуплоидии (ЭКО с ПГТ-А)

• преимплантационного генетического тестирования эмбрионов на анеуплоидии (ЭКО с ПГТ-А)

  Комментарий 1:
  
  Показания для проведения предимплантационной диагностики:
  
  * Возраст женщины старше 34 лет
  
  * Возраст мужчины старше 39 лет
  
  * Носительство хромосомных перестроек, транслокаций, инверсий и других хромосомных и генетических патологий
  
  * Привычное невынашивание беременности (более 2 выкидышей)
  
  * Неудачные попытки ЭКО в анамнезе (более двух)
  
  Учебник для среднего профессионального образования коллектив авторов Акуленко Л.В., Угаров И.В.
  
  http://topuch.ru/uchebnik-dlya-srednego-professionalenogo-obrazovaniya-kollekti/index.html
  
  Комментарий 2: Повышен возрастной риск рождения больного ребенка с хромосомной патологией.
  
  3+a| Трисомии 13, 18, 21
  
  a| a| Возраст матери, годы a| Риск, %
  
  .7+a| Суммарный популяционный риск в зависимости от возраста матери a| < 19 a| 0,08
  
  a| 20-24 a| 0,06
  
  a| 25-29 a| 0,1
  
  a| 30-34 a| 0,2
  
  a| 35-39 a| 0,54
  
  a| 40-44 a| 1,6
  
  a| >45 a| 4,2
  
  3+a| *Трисомия 21 (синдром Дауна)*
  
  a|
  
  2+^a| Повторный риск для сибсов пробанда в зависимости от возраста матери
  
  a|
  
  a| Возраст матери, годы a| Риск, %
  
  a| Простая трисомная форма a| До 35
  
  Свыше 35 a| 1
  
  Удвоенный риск для данной возрастной группы
  
  {nbsp}
  
  Бочков, Н.П. Наследственные болезни/ Н.П. Бочков, Е.К. Гинтер, В.П. Пузырев. - М.:ГЭОТАР Медиа, 2012. - с.792
  
  (1)
  
  {nbsp}
  
  Схема нарушения расхождения хромосом во 2-м делении мейоза и морфология ооцита в зависимости от возраста женщины.
  
  Gardner RJM, Sutherland GR. Chromosome Abnormalities and Genetic Counselling. Oxford University Press. 2011; 4: р.40

Правильный ответ: трисомия хромосомы 13

• трисомия хромосомы 13

  Согласно номенклатуре ISCN 2016
  
  ISCN (2016): An International System for Human Cytogenetic Nomenclature, Reprint of: Cytogenetic and Genome Research 2016

Правильный ответ: не рекомендован

• не рекомендован

  Комментарий: Согласно полученным результатам ПГТ-А (Т1: seq(13)x3,(X)x2) молекулярный кариотип эмбриона, соответствующего образцу Т1, с высокой степенью вероятности является анеуплоидным – характеризуется наличием полной формы трисомии хромосомы 13, что соответствует синдрому Патау.
  
  Эмбрионы с синдромом Патау частично жизнеспособны. Частота рождения детей с этим синдромом не превышает 1:6000.
  
  Продолжительность жизни таких детей в среднем составляет 1 год, вследствие наличия различнх пороков развития внутренних органов. Дети, достигающие более старшего возраста, имеют выраженную степень умственной отсталости.
  
  Генетика. Учебник для вузов/Под. ред. академ. РАМН В.И. Иванова. - М.: ИКЦ «Академкнига», 2006,2007 - 639 с.:ил. (Глава 20, Хромосомные аномалии и обусловленные ими синдромы. Раздел 20.2.1.3 Трисомия по 13 хромосоме или синдром Патау, стр. 422)
  
  Комментарий: Согласно номенклатуре ISCN 2016
  
  ISCN (2016): An International System for Human Cytogenetic Nomenclature, Reprint of: Cytogenetic and Genome Research 2016

Правильный ответ: Патау

• Патау

  Минимальные диагностические признаки трисомия 13 хромосомы; микроцефалия, полидактилия, расщелина губы и неба.
  
  Козлова С.И., Демикова Н.С. Наследственные синдромы и медико-генетическое консультирование: Атлас-справочник. 3-е изд., перераб. и дополн. М.:Т-во научных изданий КМК; Авторская академия.2007. 448 с., 236 ил. - с.286