Генетика - кейс 103 — задача № 103

Правильные ответы: ЭЭГ-видеомониторинг; МРТ головного мозга

• ЭЭГ-видеомониторинг

  ЭЭГ-видеомониторинг позволяет определить, являются ли наблюдаемые клинически у пациента пароксизмы следствием изменения электрофизиологической активности мозга
  
  Комментарии: Диагностику эпилепсии и эпилептического синдрома в соответствии с классификацией следует проводить на основании анамнеза и физикального обследования, данных ЭЭГ, включая видео-ЭЭГ мониторинг при необходимости, с учетом данных нейровизуализации (КТ, МРТ).
  
  Неврология. Национальное руководство. Краткое издание / под ред. Е. И. Гусева, А. Н. Коновалова, А. Б. Гехт. - М. : ГЭОТАР-Медиа, 2018. - 688 с. - ISBN 978-5-9704-4405-4.
  
  Комментарии: электроэнцефалографическое исследование — основной электрофизиологический метод, используемый в диагностике эпилепсии. Целью ЭЭГ- исследования при эпилепсии является выявление типичных (специфических) электрофизиологических признаков, соответствующих той или иной форме болезни []. При некоторых формах эпилепсии у детей, когда данные обычного ЭЭГ-исследования оказываются недостаточно информативными, показано проведение видео-ЭЭГ- мониторинга в период бодрствования и сна (продолжительная регистрация ЭЭГ с одновременной видеозаписью в течение 1,5–24 часов). При интериктальном ЭЭГ- мониторинге чаще выявляется паттерн “угнетение/вспышка, который становится более отчетливым в период сна (фаза глубокого сна). Могут выявляться: гипсаритмия, генерализованная пик-волновая или полипик-волновая активность, фокальные и мультифокальные пики, острые волны.
  
  Клинические рекомендации.
  Последствия перинатального поражения центральной нервной системы с эпилепсией.
  
  https://library.mededtech.ru/rest/documents/kr_epil/[Клинические рекомендации.
  Последствия перинатального поражения центральной нервной системы с эпилепсией, 2016 г.]
  
  (1)

• МРТ головного мозга

  МРТ головного мозга позволяет оценить возможное наличие органической причины судорог
  
  Комментарии: Диагностику эпилепсии и эпилептического синдрома в соответствии с классификацией следует проводить на основании анамнеза и физикального обследования, данных ЭЭГ, включая видео-ЭЭГ мониторинг при необходимости, с учетом данных нейровизуализации (КТ, МРТ).
  
  Неврология. Национальное руководство. Краткое издание / под ред. Е. И. Гусева, А. Н. Коновалова, А. Б. Гехт. - М. : ГЭОТАР-Медиа, 2018. - 688 с. - ISBN 978-5-9704-4405-4.
  
  Комментарии:МРТ проводится с целью выявления структурных аномалий головного мозга. Диффузионное МРТ-исследование — один из новых видов МРТ-определения «каналов» белого вещества в глубоких слоях мозга (их обнаружение позволяет предотвратить развитие неврологического дефицита при нейрохирургическом вмешательстве). Функциональное МРТ-исследование (фМРТ) — прогрессивный метод нейровизуализации, определяющий функционально значимые участки мозга (речевые центры и моторные зоны), являющиеся индивидуальными для каждого пациента.
  
  Даже при идиопатических генерализованных эпилепсиях, обычно не сопровождающихся патологическими изменениями при МРТ-исследовании, фМРТ позволяет в ряде случаев обнаружить структурные и/или функциональные аномалии.
  
  Клинические рекомендации.
  Последствия перинатального поражения центральной нервной системы с эпилепсией.
  
  https://library.mededtech.ru/rest/documents/kr_epil/[Клинические рекомендации.
  Последствия перинатального поражения центральной нервной системы с эпилепсией, 2016 г.]
  
  (1)

Правильный ответ: микроцитогенетических синдромов

• микроцитогенетических синдромов

  При наличии стигм дизэмбриогенеза у ребёнка с задержкой психомоторного и речевого развития и судорожным синдромом в первую очередь следует предполагать наличие дисбаланса хромосомного набора, в том числе вследствие структурного нарушения хромосом (микроделеции или микродупликации).
  
  Комментарии: Для большинства хромосомных синдромов, обусловленных аномалиями аутосом, характерны пренатальная гипотрофия, пороки развития двух и более органов и систем, а также задержка темпов раннего психомоторного развития, олигофрения и снижение показателей физического развития ребёнка. У детей с хромосомной патологией часто выявляют увеличение количества, так называемых, стигм дизэмбриогенеза или малых аномалий развития……
  
  Генетика. Учебник для вузов/Под.ред. академ.РАМН В.И. Иванова. - М.: ИКЦ«Академкнига», 2006,2007 - 639 с.:ил., стр. 417-418

Правильные ответы: стандартное цитогенетическое исследование; хромосомный микроматричный анализ; биохимический анализ крови методом тандемной масс-спектрометрии

• стандартное цитогенетическое исследование

  Цитогенетическое исследование показано при наличии микроаномалий развития, задержке умственного и физического развития, врождённых пороков развития.
  
  Наследственные болезни: национальное руководство / под ред. акад. РАМН Н.П. Бочкова, акад. РАМН Е.К.Гинтера, акад. РАМН В.П.Пузырева. – М.:ГЭОТАР-Медиа. 2012.-936 с., с. 453.

• хромосомный микроматричный анализ

  При сочетании судорог, нарушениях физического и психомоторного развития при наличии микроаномалий и нормальном кариотипе может быть рекомендовано исследование на наличие хромосомного дисбаланса методом хромосомного микроматричного анализа.
  
  Комментарий: Хромосомный микроматричный анализ (array-CGH, array-based Comparative Genome Hybridization) – современный молекулярно-цитогенетический метод, основанный на конкурентной гибридизации двух геномных ДНК-библиотек (одной, полученной из лимфоцитов периферической крови пациента с предполагаемым хромосомным нарушением, второй – контрольного образца от здорового индивида с нормальным кариотипом) на микроматрицах, представленных большим числом олигонуклеотидных ДНК-проб, с высокой плотностью покрывающих весь геном. В случае наличия хромосомного дисбаланса в кариотипе пациента (делеции или дупликации) соответствующий регион хромосомы будет выявлен за счет изменения в нем соотношения интенсивностей флуоресценции анализируемой и контрольной ДНК-библиотек. В зависимости от плотности используемых ДНК-микрочипов с помощью данного метода можно диагностировать хромосомные микроделеции и микродупликации, протяженностью от нескольких десятков тысяч пар нуклеотидов, невидимые при стандартном кариотипировании.
  
  Наследственные болезни: национальное руководство / под ред. акад. РАМН Н.П. Бочкова, акад. РАМН Е.К. Гинтера, акад. РАМН В.П. Пузырева. — М. : ГЭОТАР-Медиа, 2012. — 936 с. Глава 17. c. 470-477. ISBN 978-5-9704-2231-1

• биохимический анализ крови методом тандемной масс-спектрометрии

  У ребёнка имеется отставание в психомоторном и физическом развитии, нарушение вскармливания, эпилептические приступы.
  
  Комментарии: Показания для применения биохимических методов диагностики у новорождённых: нарушения сознания, судороги, нарушения ритма дыхания, мышечная гипотония, нарушения вскармливания, желтуха, специфический запах мочи и пота, метаболический ацидоз с дефицитом оснований, гипогликемия. У детей более старшего возраста биохимические методы используют во всех случаях подозрения на НБО (задержка физического и умственного развития, потеря приобретённых функций, увеличение размеров внутренних органов), а также при клинической картине, специфичной для определённого заболевания.
  
  Наследственные болезни: национальное руководство / под ред. акад. РАМН Н.П. Бочкова, акад. РАМН Е.К.Гинтера, акад. РАМН В.П.Пузырева. – М.:ГЭОТАР-Медиа. 2012.-936 с., с. 438-439; с.441.

Правильный ответ: микроцефалия, моногенная форма

• микроцефалия, моногенная форма

  У ребёнка отмечается прогрессирующая микроцефалия.
  
  Согласно анамнезу - данные за внутриутробную инфекцию не представлены.
  
  В результате проведённого обследования исключены нарушения обмена веществ и хромосомный дисбаланс.

Правильный ответ: клиническое или полное секвенирование экзома методом NGS

• клиническое или полное секвенирование экзома методом NGS

  Так как хромосомный дисбаланс и нарушения обмена веществ исключены, и предполагаемым диагнозом является микроцефалия моногенной природы, целесообразно провести молекулярно-генетическое исследование. Моногенные формы микроцефалии характеризуются значительной генетической гетерогенностью (описано несколько десятков моногенных генетических вариантов, в том числе первичной аутосомно-рецессивной микроцефалии не менее 25 вариантов).
  
  https://omim.org/phenotypicSeries/PS251200
  
  Для дифференциальной диагностики генетически гетерогенных заболеваний наиболее целесообразно проводить поиск мутаций во всех генах, ответственных за их возникновение, одновременно.
  
  В связи с чем для таких заболеваний, наиболее эффективным диагностическим методом является проведение клинического или полного секвенирования экзома методом NGS.
  
  Ребриков Д.В., Коростин Д.О., Шубина Е.С., Ильинский В.В.NGS. Высокопроизводительное секвенирование. — М.: Бином 2014. — 232 с. —
  ISBN 978-5-9963-1784-4
  
  (Раздел 12.1.Генетическое тестирование с использованием NGS, стр. 207-220)

Правильный ответ: обследовать мальчика и его биологических родителей на наличие выявленных нуклеотидных замен методом секвенирования по Cенгеру

• обследовать мальчика и его биологических родителей на наличие выявленных нуклеотидных замен методом секвенирования по Cенгеру

  Комментарий: В настоящее время NGS зарегистрирован как научный метод исследования, поэтому для установления диагноза на молекулярно-генетическом уровне необходимо все находки подтверждать с помощью «золотого стандарта» - секвенирования по Сенгеру.
  
  http://med-gen.ru/about/Structure/sekvenirovanie-po-sengeru.php
  
  Комментарий: Обязательно проведение подтверждения результатов анализа NGS с помощью ортогональных методов для всех вариантов сиквенса, классифицированных как патогенные, вероятно патогенные и неопределенного значения для Менделевских заболеваний. Методы могут включать, но не ограничены: секвенирование таргетной области ДНК по Сенгеру, рестрикционный анализ, MLPA анализ, тестирование членов семьи пациента.
  
  О.П. Рыжкова, А.В. Поляков, М.Ю. Скоблов и др.
  Рекомендации для интерпретации данных, полученных методом Next Generation Sequencing (NGS), 2016 г., стр.22
  
  Комментарий: Все варианты нуклеотидной последовательности, указанные в заключении, должны быть подтверждены секвенированием по Сэнгеру или другой валидированной технологией.
  
  Рыжкова О.П., Кардымон О.Л., Прохорчук Е.Б. и др.
  Руководство по интерпретации данных последовательности ДНК человека, полученных методами массового параллельного секвенирования (MPS) (редакция 2018, версия 2), стр. 14– но это статья
  
  Обследование родителей на наличие выявленной мутации необходимо для оценки роли выявленной нуклеотидной замены в этиологии заболевания ребёнка
  
  Комментарий: Обязательно проведение подтверждения результатов анализа NGS с помощью ортогональных методов для всех вариантов сиквенса, классифицированных как патогенные, вероятно патогенные и неопределенного значения для Менделевских заболеваний. Методы могут включать, но не ограничены: секвенирование таргетной области ДНК по Сенгеру, рестрикционный анализ, MLPA анализ, тестирование членов семьи пациента.
  
  О.П. Рыжкова, А.В. Поляков, М.Ю. Скоблов и др.
  Рекомендации для интерпретации данных, полученных методом Next Generation Sequencing (NGS), 2016 г., стр.22
  
  Комментарий: Проведение дополнительных анализов, таких как секвенирование по Сэнгеру для верификации выявленных вариантов, анализ ДНК родителей для установления цис-, транс- положения выявленных вариантов, вариантов de novo, родства и др.
  
  Рыжкова О.П., Кардымон О.Л., Прохорчук Е.Б. и др.
  Руководство по интерпретации данных последовательности ДНК человека, полученных методами массового параллельного секвенирования (MPS) (редакция 2018, версия 2), стр. 15– но это статья

Правильный ответ: Микроцефалия, 15 тип, первичная, аутосомно-рецессивная (OMIM:* 616486 )

• Микроцефалия, 15 тип, первичная, аутосомно-рецессивная (OMIM:* 616486 )

  Мутации в гене _MFSD2A_ (OMIM:* 614397 ) в гомозиготном и компаунд-гетерозиготном состоянии приводят к развитию первичной микроцефалии 15 типа, клиническая картина которой совпадает с фенотипом обследуемого (OMIM:* 616486 )

Правильный ответ: аутосомно-рецессивный

• аутосомно-рецессивный

  Согласно базе данных OMIM первичная микроцефалия 15 типа (OMIM: 616486) наследуется аутосомно-рецессивно.

Правильный ответ: 25% независимо от пола

• 25% независимо от пола

  Микроцефалия 15 типа, первичная (OMIM:* 616486) – аутосомно-рецессивное заболевание.
  
  Комментарий: Аутосомно-рецессивный тип наследования характеризуется передачей заболевания от здоровых родителей детям с вероятностью 25%.
  
  Генетика. Учебник для вузов/Под.ред. академ.РАМН В.И. Иванова. - М.: ИКЦ«Академкнига», 2006,2007 - 639 с.:ил., стр. 453, стр. 455

Правильный ответ: пренатальную ДНК-диагностику на сроке 10-12 недель, направленную на поиск мутации в гене _MFSD2A_

• пренатальную ДНК-диагностику на сроке 10-12 недель, направленную на поиск мутации в гене _MFSD2A_

  Комментарии: Пренатальная (дородовая) диагностика является по сути частью третьего этапа медико-генетического консультирования и не является обязательной; представляет собой один из основных подходов, позволяющих выявить генотипы, определяющие высокий риск развития заболевания у будущего ребёнка, и включает комплекс мероприятий, направленных на предотвращение появления больного ребёнка в семье.
  
  Генетика. Учебник для вузов/Под.ред. академ.РАМН В.И. Иванова. - М.: ИКЦ«Академкнига», 2006,2007 - 639 с.:ил., стр. 573 – 574
  
  Комментарии: Преимплантационная диагностика является вторым подходом, позволяющим выявить генотипы, определяющие высокий риск развития заболевания у будущего ребёнка.
  
  Преимуществом является отсутствие необходимости искусственного прерывания беременности при обнаружении наследственной патологии у эмбриона.
  
  Генетика. Учебник для вузов/Под.ред. академ.РАМН В.И. Иванова. - М.: ИКЦ«Академкнига», 2006,2007 - 639 с.:ил., стр. 573 - 577
  
  Комментарии: Одним из основных показаний к инвазивной пренатальной диагностике является носительство супругами мутаций генов моногенных заболеваний.
  
  Акушерство : национальное руководство под ред. Г. М. Савельевой, Г. Т. Сухих, В. Н. Серова, В. Е. Радзинского. ГЭОТАР-Медиа, 2018
  
  (1)
  
  Комментарии: Пренатальная и предимплантационная диагностика Проводимая в настоящее время молекулярно-генетическая пренатальная диагностика предусматривает либо забор плодного материала (хорионбиопсия, амниоцентез, кордоцентез), либо отбор эмбрионов при проведении ЭКО. В первом случае инвазивная процедура сама по себе несет небольшой риск осложнения течения беременности. По этой причине следует уделять особое внимание обоснованию показаний к проведению такого тестирования. В частности, в этих случаях необходимо предварительно провести тестирование родителей плода и убедиться в существовании мутаций, которые могут быть переданы ребенку.
  
  Наследственные болезни: национальное руководство. Под ред. Н.П. Бочкова, Е.К. Гинтера, В.П. Пузырева. 2012.(Серия "Национальные руководства»
  
  (1)
  
  Комментарии: Хорионбиопсия - инвазивный метод получения ворсин хориона для диагностики генетически обусловленных нарушений плода. Оптимальный срок выполнения манипуляции - 10-12 недель гестации, при толщине хориона не менее 1 см. В более поздние сроки (12-15 недель) можно выполнить плацентоцентез.
  
  В отличие от амнио- и кордоцентеза, это исследование позволяет получить информацию о врожденных дефектах плода на самых ранних стадиях его развития - в конце I триместра беременности.
  
  Акушерство : национальное руководство под ред. Г. М. Савельевой, Г. Т. Сухих, В. Н. Серова, В. Е. Радзинского. ГЭОТАР-Медиа, 2018
  
  (2)

Правильный ответ: симптоматическое

• симптоматическое

  Для данного генетического варианта заболевания, также как для большинства наследственных болезней, иные формы терапии не разработаны
  
  Комментарии: Для многих форм наследственных заболеваний симптоматическое лечение – единственно возможное, позволяющее улучшить качество жизни пациентов.
  
  Наследственные болезни: национальное руководство / под ред. акад. РАМН Н.П. Бочкова, акад. РАМН Е.К.Гинтера, акад. РАМН В.П.Пузырева. – М.:ГЭОТАР-Медиа. 2012.-936 с. - с.728
  
  Комментарии: Симптоматическое лечение используется при всех наследственных заболеваниях.
  
  Генетика. Учебник для вузов/Под.ред. академ.РАМН В.И. Иванова. - М.: ИКЦ«Академкнига», 2006,2007 - 639 с.:ил.; (Глава 26. Лечение наследственных болезней (26.1 Симптоматическое лечение) - стр. 592)

Правильный ответ: для оценки генотипа эмбриона/плода необходима разработка косвенных методов ДНК-диагностики

• для оценки генотипа эмбриона/плода необходима разработка косвенных методов ДНК-диагностики

  Комментарии: Косвенные методы ДНК-диагностики применяют в том случае, если ген, повреждение в котором приводит к заболеванию, не идентифицирован, а лишь локализован на определённой хромосоме, или когда методы прямой ДНК-диагностики не дают результата…….
  
  Генетика. Учебник для вузов/Под.ред. академ.РАМН В.И. Иванова. - М.: ИКЦ«Академкнига», 2006,2007 - 639 с.:ил.; (Раздел 19.4.3. Молекулярно-генетические методы диагностики наследственных заболеваний человека. Косвенные методы ДНК-диагностики) - стр. 409)